Бесплатный доступ.

Уважаемые коллеги, у нас появилась уникальная возможность бесплатного доступа к контенту международного журнала Echocardiography, который выпускается под эгидой авторитетного американского медиа-концерна Wiley. Ну, если не ко всем его публикациям, то к одной из его статей - наверняка.

Вот она, эта статья на сайте Echocardiography Wiley (ссылка и скриншот 1

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/echo.15496

Как видите, уважаемые коллеги, обычный доступ для рядовых читателей журнала стОит от 12 до 49 долларов. Однако, благодаря щедрости наших коллег-вальсальвовцев, мы сможем читать эту статью совершенно бесплатно. Вот их ссылка

https://valsalva.ru/download/file.php?id=17791

"Влияет ли размер правого желудочка на размер и функцию левого желудочка у детей с аномалией Эбштейна?"

Авторы - профессор Соколов А.А. и его коллеги из Томского НИИ кардиологии.

Понимаю ваш здоровый скепсис, уважаемые коллеги. И совершенно с вами согласен, что большинство из нас не часто смотрит детей, что аномалию Эбштейна почти никто из нас не видел, и что вопросами корреляции размера ПЖ с размером и функцией ЛЖ мы никогда не занимались и заниматься в обозримом будущем наверняка не будем.

И тем не менее, данная статья может быть полезной и для нас. Как минимум, для тех из нас, кто собирается писать статьи для научных журналов. Она является наглядным примером того, как можно грамотно составить научную статью. Настолько грамотно, что ею могут заинтересоваться даже такие искушёные в высококачественной научной периодике специалисты, как редакторы американского издательства Wiley - старейшей в США и крупнейшей в мире организации, занимающейся публикацией научной литературы.

Впрочем, иметь представление о том, как составляется научная статья, полезно не только "писателям", но и "читателям" тоже. Хотя бы для того, чтобы понимать, о чём там идёт речь.

Итак, уважаемые коллеги, давайте рассмотрим статью повнимательнее. С методологической точки зрения.

1.Введение (Introduction).

Понятно, что введение - это краткая характеристика исследуемой темы. Лаконичный стиль был изобретён древними спартанцами ещё до Рождества Христова, но и поныне он не утратил своей привлекательности. А сопровождающая текст 3-D реконструкция, в качестве пояснительной иллюстрации, выглядит вполне эффектно.

2.Описание методики исследования (Methods).

Считается, что любое научное исследование должно быть воспроизводимым. Поэтому описывать методику исследования нужно настолько понятно, чтобы повторить его смог любой желающий.

Для этого, в статье указаны критерии отбора пациентов ("displacement the coaptation point of the TV leaflets to the apex of the RV more than 8 mm/m2.4") и перечислены измеряемые параметры:

1)The displacement index - смещение створок ТК, индексированное к площади тела.

2)The volume of the heart chambers - объёмы камер сердца.

3)The atrial index - соотношение объёмов правого и левого предсердий.

4)The left atrial shape index (LASI) - индекс формы левого предсердия. Отражает соотношение трёх измерений предсердия. Вычисляется по формуле, формула - в тексте.

5)The force of the LA contraction - сила сокращения левого предсердия. Указан метод калькуляции.

6)The sphericity index of the left ventricle - индекс сферичности левого желудочка. (Объяснение в тексте).

7)LV eccentricity - эксцентричность левого желудочка. (Объяснение в тексте. Кроме того, интуитивно понятно).

8)The myocardial performance index (MPI) для левого и правого желудочков - индекс Tei. (Знаком всем кардиологам).

9)VTI - интеграл потока на выходе из ПЖ. Здесь - как суррогатный индикатор насосной функции правого желудочка.

Дополнительно указано, что измерения проводились в соответствии с рекомендациями АSЕ, что у родителей всех детей получено информированное согласие, и что исследование было одобрено институтским комитетом по клиническим исследованиям и этике. Модели аппаратов и типы датчиков также были подробно указаны. Теперь понятно, почему у редакторов журнала Echocardiography Wiley не возникло вопросов по поводу этого раздела статьи.

3.Статистический анализ.

Статистика - это, конечно, отдельная большая наука, но о некоторых её понятиях желательно бы и нам иметь хотя бы некое общее представление.

Continuous variables (непрерывные переменные) - это те цифры, которые мы получаем в процессе измерений.

Mean - это та цифра, которая расположена ровно посерёдке вариационного ряда.

Median - это тоже "средняя" цифра, но немножко в другом смысле. То есть, существует ровно 50% элементов, которые меньше медианы, и ровно 50% элементов, которые больше медианы.

Interquartile range - это межквартильный размах. То есть, интервал между первым квартилем и третим квартилем.

Первый квартиль - это "среднее" число между минимальным и медианным. Иными словами, это означает, что существует ровно 25% элементов, которые меньше первого квартиля, и ровно 75% элементов, которые больше его.

Третий квартиль - это "среднее" число между медианным и максимальным. Иными словами, это означает, что существует ровно 75% элементов, которые меньше третьего квартиля, и ровно 25% элементов, которые больше его.

В графическом варианте, межквартильный размах выглядит так (скриншот 2

Или так (скриншот 3

Или так (скриншот 4

Для бОльшей точности, в качестве минимального значения, берут не абсолютный минимум, а немножко отступают от него. Аналогично поступают и с абсолютным максимумом. Насколько отступить, вычисляют по определённой формуле. Но, поскольку мы, медики, в формулах - не ахти (за исключением, разве что, нашего уважаемого Юрия Юрьевича), то для нас, медиков, просто, указывают поправочный коэффициент, по которому этот диапазон рассчитывался (см скриншот 5

Mean - это среднее число, а SE - это "стандартная ошибка" (standard error). SE вычисляется по формуле, формула в википедии. А почему "1.96*SE"? Да потому что, если мы SE умножим на 1,96, то получим интервал, в который обычно укладывается 95% данных. Такой интервал вполне заслуживает доверия. Поэтому он так и называется - "доверительный интервал" (confidential interval).

С понятием доверия к статистическим данным связан еще один показатель, это Р-value. Он показывает (извините за тавтологию) статистическую значимость выборки, поскольку отражает количество ошибочных данных. Общепринятым является предел ошибки в 5%, что соответствует р=0,05. Поэтому р-value в любом исследовании должен быть меньше 0,05.

На графике Figure 2, роль интерквартильного размаха выполняет диапазон, раскинувшийся от "mean - SE" до "mean + SE". (См скриншот 6

А если мы посмотрим на таблицу Table 1, то увидим там (M ± Δ). (скриншот 7

(M ± Δ) означает (mean ± SD). Что такое mean, мы уже знаем, а SD - это "стандартное отклонение" (standard deviation). Вычисляется по формуле, формула тоже в википедии.

Kolmogorov-Smirnov test. Он нужен для того, чтобы выяснить, является ли распределение цифр в выборках нормальным, т.е., Гауссовым, или не является таковым (скриншот 8

Если распределение, извините, "нормальное", то для дальнейшего анализа применяется Student's t-test. Если - нет, то применяется Mann-Whitney U-test.

Pearson correlation coefficient. Обозначается буквой r, позволяет оценить корреляцию между различными величинами. Например, между индексированным объёмом правого предсердия и сферичностью левого желудочка (скриншот 9

Чем ближе этот коэффициент к "1" (или к "-1", для обратной зависимости), тем сильнее корреляция. Чем ближе коэффициент к "0", тем она слабее. На графике, он равен 0,48063, и значит корреляция - так себе, серединка-на-половинку.

А "0,95 Conf.Int" - это не что иное, как уже известный нам confidential interval, который составляет 95%. Пишется это для того, чтобы убедить читателей, что данная статистическая выборка заслуживает доверия.

Лучше обьяснить статистику я не могу - сам не знаю. Машина, конечно, знает и даже применяет. Но как она это делает - не расскажет. Рассказать могут больничный сисадмин и программисты из отдела автоматизации. Их и надо расспрашивать, если кому-то очень уж приспичит.

4.Results (Результаты) и

5.Discussion (Oбсуждение)

Думаю, что эти разделы статьи вряд ли будут нам, форумчанам, особо интересными. Мы даже взрослой ЭхоКГ интересуемся так, через пень-колоду. А уж редкие врождённые пороки, такие, как болезнь Эбштейна - это, по нашим представлениям, вообще находится где-то за пределами нашей галактики.

Но зато, вооружившись знанием принципов визуального отображения статистических данных, мы теперь сможем без труда понимать любые графики и таблицы.

Например, мы понимаем, что на графике "Figure 2" (скриншот 10

индексированный к площади тела объём левого желудочка у пациентов с аномалией Эбштейна составлял, в среднем, 40,5 мл/кв.м, что общий разброс параметров находился в диапазоне от 38,2 до 43 мл/кв.м, а межквартильный разброс (или, скорее, его аналог) находился в диапазоне от 39,4 до 41,8 мл/кв.м. Видим также, что у здоровых детей индексированный к площади тела объём левого желудочка значительно больше, чем у больных - 44,5 мл/кв.м, а общий разброс и межквартильный разброс значительно меньше.

Так ведь?

В таблице 1 (скриншот 11

мы видим, что средний индексированный объём левого предсердия у детей с аномалией Эбштейна составил 19,9 мл/кв.м, при стандартной девиации 6,3 мл/кв.м, а у здоровых детей - 19,0 мл/кв.м, при стандартной девиации 5,2 мл/кв.м. При этом, р-показатель составил 0,33, и значит, эта выборка не является статистически значимой (то есть, достоверной).

А вот средний индексированный объём правого предсердия у детей с аномалией Эбштейна составил 90,5 мл/кв.м, при стандартной девиации 15,5 мл/кв.м, причем у здоровых детей он составил 19,9 мл/кв.м, при стандартной девиации 5,3 мл/кв.м. И здесь р-показатель составил 0,0001, а это значит, что эта выборка является статистически значимой (то есть, является достоверной).

И дальше, в том же духе.

Вот так, легко и непринуждённо, с шуточками и прибауточками, мы с вами, уважаемые коллеги, научились писать научную статью. Теперь не стыдно послать её в любой журнал, даже в иностранный. Но нужно иметь ввиду, что писать желательно на английском языке, потому что в отечественных журналах требования к научной новизне публикаций более жёсткие, чем в зарубежных. (Скриншот 12

Впрочем, поведение наших редакторов вполне предсказуемо. В области науки, мы ещё с советских времён, "впереди планеты всей". И темп, взятый тогда, не снижаем.

Конфликт интересов.

Автор поста не имеет финансовых обязательств перед Томским НИИ Кардиологии и издательством John Wiley & Sons, не занимается скрытой рекламой этих организаций, и не работает ни в одной из них.

РS. Вот здесь хорошо описана статистика

http://www.sevin.ru/dissertations/aspirantura/mate...

РРS. Уважаемые коллеги! Напоминаю, что в текстах постов самопроизвольно возникают искажения, а иллюстрации, из разных постов, самопроизвольно меняются местами. Модераторы объясняют это техническим несовершенством сайта. Почему это "техническое несовершенство" портит только самые интересные и информативные посты, остаётся загадкой.